Первые евреи, принадлежавшие к общине бухарских (фарсоязычных) евреев, появились на территории нынешнего Таджикистана в XVII–XVIII вв. В XX в. к ним прибавились евреи-ашкеназы – главным образом приехавшие в советские времена специалисты и члены их семей. В 1959 г. еврейское население Таджикистана составляло 13,4 тысячи человек. К 1989 г. его численность упала до 11 000. Единственным еврейским общественным институтом, действовавшим в советский период, были синагоги в Душанбе и Худжанде (тогда – Ленинабаде).
В конце 1980-х – начале 1990-х гг. в связи с общей нестабильностью (в 1992 – 1997 гг. в стране шла гражданская война) большинство евреев Таджикистана эмигрировали преимущественно в Израиль и отчасти в США и Россию.